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卵白组学

标记卵白组TMT

TMT(Tandem Mass Tag)手艺由美国Thermo Fisher Scientific开发的一种多肽体外标记手艺。该手艺接纳了6标(TMTsixplex™ Isobaric Label Reagent Set)、10标(TMT10plex™ Isobaric Label Reagent Set )、16标(TMTpro 16plex)、18标(TMTpro 18plex)等同位素标签,通过与肽段特异氨基酸位点相连实现差别泉源的肽段标记,然后举行串联质谱剖析,监测碎裂下来的标签实现肽段定量。一次实验可无邪较量最多18种差别样本中卵白质的相对含量。

TMT试剂主要由3部分组成:报告基团、平衡基团和肽反应基团。以6标试剂为例:报告基团相对分子质量划分为126、127、128、129、130和131 ;平衡基团相对分子质量划分为103、102、101、100、99和98,这样就形成了6种相对分子质量均为229的等量异位标签。报告离子的强度就代表了响应样品中卵白质/肽段的强度,实现了对差别样本中卵白质的定性和定量剖析。
 
手艺优势

1. 迅速度高:低品貌卵白也能检测出
2. 适用规模广:险些可对任何物种的种种卵白质举行疏散判断
3. 高通量:能同时对18组样本中包括的卵白举行判断及表达差别剖析
4. 高效:液相色谱与串联质谱连用,自动化操作,剖析速率快,疏散效果好

 
样本起始量与送样建议

样本类型 起始量
动物及临床脏器组织/脑组织等 >20mg
动物及临床皮肤/骨/血管/脂肪组织等 >100mg
植物叶片组织/花 >200mg
植物根/茎/果实/种子 >500mg
原代细胞/细胞系 >5×106
总RNA >100μg
 
注重事项:详细样本准备指南,请联系在线客服。
 
生物信息学剖析内容

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项目文章

Luo Z, Peng W, Xu Y, Xie Y, Liu Y, Lu H, Cao Y, Hu J. Exosomal OTULIN from M2 macrophages promotes the recovery of spinal cord injuries via stimulating Wnt/β-catenin pathway-mediated vascular regeneration. Acta Biomater. 2021 Dec;136:519-532. PMID: 34551329.

常见问题
 
1. iTRAQ及TMT等标记定量卵白质组手艺有什么特点?

iTRAQ以及TMT等标记定量卵白质组手艺区分率高,细胞样品最多可判断凌驾6000个卵白,并且绝大大都卵白都有定量和定性信息 ;其次是通量高,可以一次最多完成8个(iTRAQ)或者10个(TMT)样品的实验,特殊适合于多组样品间的同时较量以及生物学历程的动态检测。

2. 没有全基因组数据的物种该怎样举行卵白的判断?

关于已经宣布全基因组序列的物种,可以在获得全序列后构建外地建库并举行外地检索 ;关于未举行全基因组测序的物种,可以接纳近缘物种的数据库或者EST数据以及转录组数据举行检索。

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